Anto berkahwin dengan penyanyi dan penulis lagu Indonesia, Melly Goeslaw pada 1995 dan dikurniakan dua anak lelaki—Anakku Lelaki Hoed dan Pria Bernama Hoed.[1]

Pada 18 November 2015, bapa beliau Prof. Dr. Benny Hoedoro Hoed, meninggal dunia di Hospital Bintaro akibat masalah kesihatan. Namun beliau tidak mendedahkan penyakit yang dihidapi bapanya.[2]